大陸衛生部於2008年初公告台、港、澳醫師證照開放認證的措施，本學會認為是對促進兩岸醫療多元化發展與其專業素質之融合、提昇一項極為重要的政策。因此，本學會承接陸方此項委辦業務，特別珍惜此項兩岸溝通管道平台。
具有台灣合法行醫資格並且是台灣永久性居民的醫師。台灣醫師可申請的大陸醫師資格類別為臨床、中醫、口腔。同時具備下列條件並符合《中華人民共和國執業醫師法》及其有關規定之醫師，可申請大陸醫師資格認定。
(三)在台灣醫療機構中執業。
三、大陸醫師資格認定作業流程（詳申請標準流程圖 ）
四、申請注意及配合事項：
(一)本作業自101年10月1日起正式上線。
(二)申請本人可來電諮詢(02-23693081)或自行於本會上網(http://www.tche.org.tw/) 申請。
(三)收費標準：每人40,000元整。說明：報名費係含行政費用及其他業務費相關費用：本學會將主動通知申請人繳納費用，並滙入指定銀行專戶；如未通過申請者，則酌收二萬元以上相關作業費用。
(四)費用繳納：申請人線上填寫換證「申請審核表」後，請以劃撥方式（戶名:社團法人台灣醫務管理學會；帳號:19483113）繳納費用，承辦人開立收據後郵寄予申請人
(五)申請人申請退件：
1.申請人需檢附(1)退件切結書 及 (2)退費申請表
2.申請人進行線上申請後5日內(含例假日)：酌收作業費用1,000元/人
註：日期計算以本會收到申請資料為計算基準
3.本學會已開始進行換證程序，過程中才申請退件時：酌收作業費用20,000元/人
(六)申請人應檢附表單與提交大陸醫師資格認定應交付文件(分二階段)：
第一階段：
1.請申請人準備資料(1)醫師證書影本(2)護照影本(3)台胞證影本(4)身分證正本。
2.本學會協助辦理良醫證【醫事人員無懲戒紀錄證明】以及良民證【警察刑事紀錄證明】。
第二階段(係指法院公證作業用)：
1.身分證正本
2.醫學系畢業證書正本
3.醫師證書正本
4.專科醫師證書正本
5.開業執照/在職證明正本
6.執業執照正本
7.詢問申請人欲送件之省份
8.白底證件照片2吋3張
(七)申請人送交之文件將由「台灣醫師大陸換照執行委員會」進行申請文件初審。
(八)本會將依申請人請求之換証省份，分別以大陸快捷郵件寄出申請相關文件後，提供交寄郵件編號予申請人，以便申請人後續查詢。
(九)如有大陸各省衛生廳回函尚需其他資料時，即通知申請人補足資料。
(十)俟本會收到申請人醫師資格證書後，以電話通知申請人，或以雙掛號將醫師資格證書正本寄至申請人通訊地址。
(十一)申請審查作業視實際大陸各省衛生廳作業程序而定。
(十二)送件省份不等於執業所在地
(十三)部分省份特別規定說明：
(1)江蘇省衛生和計劃生育委員會：該委員會要求申請人需檢附在台期間該申請人過去於所有縣市衛生局執業之狀況，亦指含各縣市衛生局之「執業動態證明」。
(2)河南省衛生和計劃生育委員會：該委員會要求需檢附該省醫院之邀請意向書。
(3)重慶市衛生和計劃生育委員會：該委員會要求需檢附該市醫院之邀請意向書。
(4)湖南省衛生和計劃生育委員會：該委員會要求需檢附該省醫院之邀請意向書；同時，該省衛計委之承辦人亦會以電話方式向邀請醫院及申請醫師本人聯繫確認。
註：上述(二)至(六)項，攸關申請人之相關作業限本人、配偶或二等親以內(須檢附相關佐證文件，如：身份證)。